在剧烈的市场竞争中，医药职业经过各种形式的联合、兼并与重组，在必定程度上改变了医药公司规划过小、规划过度涣散的局势，进步了出产会集度。医药职业已有25家公司进入国家520家大型公司的队伍。医药工业出售额前60家公司的出产会集度为35.7%，比"八五"末的19.7%进步了16个百分点，一批优势名牌公司在剧烈的市场竞争中逐步开展壮大。青霉素、维生素C、组成维生素E、阿斯匹林、扑热息痛等大吨位商品的出产公司数量已大幅度削减。片剂、粉针剂、水针剂、输液、胶囊5大类制剂前50家的出产会集度别离到达44.3%、97.6%、66.5%、58.9%和56.2%。

　　所有制构造进一步调整，根本构成了以公有制为主体、多种所有制经济共同开展的格式。按产量核算，股份制经济在全职业的比重已从"九五"前期的12%上升到33.2%，"三资"经济从15%上升到18.8%，国有经济从55%下降到36.1%。

　　医药流转体制改革脚步加速，医药商业打破了长时间计划经济体制下构成的国有商业一统天下的格式，产权构造向多样化方向开展，组建了一批较标准的股份制公司和规划较大的公司集团。运营方式开端改变，总代理、总经销，会集配货，连锁运营等新的运营方式不断涌现，尤其是连锁运营在"九五"时期有较大的开展，全国已在一些大中城市树立了近200家医药连锁公司，连锁运营的药店超越5000个。一批公司活跃进行了医药电子商务的探究与试点。

　　西部区域的医药经济有了长足开展。四川己变成我国中药出产大省，云南、贵州、青海、甘肃、内蒙、广西等省区充分发挥本地资源优势，已变成我国民族药出产基地，促进了本地的经济开展，优化了区域经济构造。

　　医药职业遵循"科教兴药"方针，加大了新商品研究开发的力度，1999年新商品产量率达15.8%。"九五"时期，我国医药公司与科研单位共获得各类新药证书5043个，触及2112个品种，其间国家一类新药证书108个。

　　临床上疗效切当、毒副作用低的β内酰胺类系列商品在抗生素类化学原料药中的比重由"八五"末的15.3%进步到1999年末的20.3%；一些紧缺的医药专用关键中间体如6－氨基青霉烷酸（6－APA）、7－氨基头孢烷酸（7－ACA）、7－氨基3－去乙酰氧基头孢烷酸（7－ADCA）、异植物醇、三甲基氢醌等根本完成了代替进口。天然维生素E，罗红霉素、阿齐霉素等重要商品完成了产业化，控释、缓释、透皮等新剂型有较大开展。

　　高效分离与纯化技能、超临界萃取技能、出产过程的自动控制技能、微囊化及靶向技能等一批高新技能在医药出产中得到推广使用。青霉素产率已由"八五"末的0.7－0.8吨/年？立方米发酵容积进步到的1.0－1.1吨，维生素C的总收率由"八五"末的48%进步到60%摆布；地塞米松出产选用生物脱氢新工艺，大幅度降低了本钱，进步了世界竞争力，不只代替了进口，并且有批量出口。

　　中药新商品开发加速，尤其是在医治与防止心脑血管、消化体系、肝炎等疾病方面的新品种有所突破。中药"杏灵颗粒"、"丹参滴丸"已经过美国FDA（美国食物与药物办理局）的预审，并进入临床试验，为中药进入世界市场又迈出了一步。藏药等民族药物也从少数民族区域走向了全国。

　　制药配备水平缓出产条件有了较大进步。"九五"时期，有一大批领先、适用的设备如双环流气升式发酵反应器、动态获取设备、微孔滤膜过滤器等完成了产业化，并广泛使用到制药工业出产中。一批公司经过了ISO9000认证。到2000年末，有780多个制药公司（车间、剂型）经过了GMP（药品出产质量办理标准）认证，药品质量有所进步。

　　医疗器械中的一些高、精、尖商品如磁共振、CT（X射线核算机断层扫描成像设备）、五颜六色B超等完成了产业化，中低能直线加速器等根本完成国产化，旋转式伽玛刀、数字减影成像体系、激光手术器、纤维光纤内窥镜等能批量出产，契合世界技能标准的全中文直接数字化X线医学影像体系在我国研制成功并投入了临床使用，大功率二氧化碳心脏激光医治仪研制成功并获得了国家专利。医疗器械商品标准逐步与世界标准接轨，零部件的配套采购已开端完成世界化，有近100家公司经过了ISO9000认证。

　　医药职业是我国最早对外开放的职业之一，也是利用外资对比成功的职业。世界排名前20位的制药公司都已在我国出资建厂。医药商业的中外合资试点工作正在顺利进行。这些"三资"公司的树立，不只引进了资金，还带来了新商品、新技能、新设备和新的运营方式与办理理念，对国内公司起到了杰出的示范作用。